1) O que é?
Serviço para processamento de dados de Projetos Científicos, composto por equipamentos de alto desempenho, onde pesquisadores e alunos de pós-graduação do Instituto de Biologia podem executar suas análises computacionais de forma rápida e eficiente.
2) Descrição
O Cluster Científico é composto por:
Item | Qtd | Descrição | RTI |
1 | 02 | Servidor Dell PowerEdge R740 | Projeto FAPESP nº 2020/10107-0 |
2 | 01 | Storage Lenovo/Netapp FAS2720 | Projeto FAPESP 2019/13005-7 |
3 | 01 | Storage Lenovo/Netapp FAS2620 | Projeto FAPESP 2018/09766-0 |
Tabela 01: equipamentos que compõem o Cluster Científico do IB.
Especificações Gerais |
Processamento | Memória RAM | Armazenamento |
192 cores (4 processadores Intel® Xeon® Gold 6252 2.1 GHz c/ 48 threads) | 1.792TB DDR4-2933MHz (896GB/nó) | 313TB de capacidade de armazenamento líquida (100TB para virtualização e 213TB para armazenamento) |
Tabela 02: especificações gerais do Cluster.
Os equipamentos estão armazenados em um Data Center Container. O local conta com autenticação eletrônica por tokens, controle e registro de acesso, monitoramento por câmera, sistema redundante de alimentação e de climatização profissional, sistema automatizado de combate a princípio de incêndio, além de nobreaks para a proteção contra surtos e quedas de energia. Um gerador é acionado caso haja falha prolongada no fornecimento de energia elétrica.
Figura 01: Storages Netapp/Lenovo FAS2620 e FAS2720
Figura 02: Servidores que compõem o Cluster Científico.
Figura 03: Racks do Data Center Container.
3) Templates
Dois Templates estão disponíveis, com a seguinte configuração:
Template 1 |
Sistema Operacional | Debian 10 x64 |
Processamento | 4 cores |
Memória RAM | 4GB |
Armazenamento | 240GB |
Tabela 03: configuração do Template 1
Template 2 |
Sistema Operacional | Ubuntu 20.04 LTS x64 |
Processamento | 4 cores |
Memória RAM | 4GB |
Armazenamento | 240GB |
Tabela 04: configuração do Template 2
Especificações personalizadas poderão ser criadas de acordo com os requisitos do projeto a ser executado e serão analisadas caso a caso.
4) Como solicitar o serviço?
Uma Ordem de Serviço (OS) deve ser aberta para a equipe de Informática no sistema Intranet do IB, pelo link https://intranet.ib.unicamp.br.
Ao abrir a OS, informar os seguintes campos:
- Nome do projeto;
- Profº/orientador responsável;
- Aluno(s) - informar nome/matrícula;
- Tempo de uso estimado da Virtual Machine (VM);
- Template a ser usado;
- Processo da agência de fomento (ex: link para o site do projeto na Fapesp).
No campo etiqueta de cadastro, utilizar o código 9700 (IS - Inexistente).
Obs: se for necessária uma especificação customizada de threads (cpu), memória e armazenamento, informar os valores e a justificativa para essa configuração.
A tratativa da solicitação será registrada na própria OS.
5) Projetos em andamento
Projetos Científicos em andamento |
Nome do Projeto | Processo(s) | Prof. Responsável /aluno(s) PG | Data de início | Previsão conclusão | Recursos alocados (CPU/Mem) |
Meta-análise multi-ômica da resposta à infecção pelo SARS-CoV-2: uma abordagem integrada com resolução celular | Fapesp: 21/00509-7 | Prof. Dr. Lício Augusto Velloso / Davi Sidarta V. R. de Oliveira Bruno Loyola Barbosa Bruna Rafaela dos Santos Silva | 02/2021 | 10/2023 | 96 cores / 300GB RAM |
Busca por novos marcadores de tamanho de adipócitos | Fapesp: 21/04048-4 | Prof. Marcelo Alves da Silva Mori / Diogo de Moraes | 03/2021 | 06/2024 | 4 cores / 40GB RAM |
Padrões de diferenciação genômica e evolução do isolamento reprodutivo entre Pitcairnias (Bromeliaceae) endêmicas de afloramentos rochosos | Fapesp: 22/03855-6 Fapesp: 18/07596-0 | Profª Clarisse Palma da Silva / Marilia Manuppella Tavares | 08/2021 | 08/2025 | 20 cores / 256GB RAM |
Adaptação local a um gradiente altitudinal em populações do complexo de espécies Pitcairnia flammea Lindl. (Bromeliaceae) no sudeste do Brasi | Fapesp: 22/03855-6 Fapesp: 18/07596-0 | Profª Clarisse Palma da Silva / Paulo Aecyo | 02/2022 | 12/2023 | 20 cores / 256GB RAM |
Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia em Materiais Complexos Funcionais, https://inomat.iqm.unicamp.br, Financiado pelo CNPq, CAPES e FAPESP | Fapesp: 14/50906-9 | Prof. Eduardo Galembeck | 09/2021 | 06/2023 | 8 cores / 8GB RAM |
Caracterização do complexo transcricional do PRDM16 envolvido na ação repressora de genes relacionados à síntese de ceramidas em adipócitos. | Fapesp: 19/15025-5 | Prof. Carlos Henrique Grossi Sponton / Fernando Bladimir Valdivieso Rivera | 07/2022 | 03/2025 | 8 cores / 40GB RAM |
O papel dos cromossomos sexuais na divergência de anuros do complexo de espécies Physalaemus cuvieri - Physalaemus ephippifer: explorando as barreiras reprodutivas em uma zona de contato entre linhagens divergentes | FAPESP 00464-3 | Profª. Luciana Bolsoni Lourenço / Joana de Moura Gama (RA 265693) | 02/2023 | 02/2025 | 16 cores / 200GB RAM |
Análise da (des)proteção das áreas úmidas do Cerrado na legislação brasileira e os desafios e perspectivas para sua conservação | Processo nº 88887.822549/2023-00 do Programa PROEX | Prof. Rafael Silva Oliveira / Alessandra Bassani (RA 193435) | 10/2023 | 07/2024 | 16 cores / 64GB RAM |
Da compreensão básica a biomarcadores clínicos para a esquizofrenia: um estudo multidisciplinar centrado na neuroproteômica | Fapesp: 17/25588-1 | Prof. Daniel Martins de Souza / Guilherme Reis de Oliveira (RA 155636) | 10/2023 | 07/2025 | 04 cores / 4GB RAM |
A evolução molecular dos cetáceos pela perspectiva dos elementos transponíveis | CAPES | Profª. Mariana Freitas Nery / Lucas Albuquerque | 10/2023 | 03/2027 | 32 cores / 32GB RAM |
Evolução molecular e padrão de expressão gênica de enzimas antioxidantes de mamíferos aquáticos tolerantes a hipoxia | Fapesp: 22/01183-0 | Profª. Mariana Freitas Nery / Giovanna Selleghin Veiga | 10/2023 | 04/2026 | 32 cores / 128GB RAM |
História biogeográfica e pegadas genômicas das famílias de golfinhos de rio Lipotidae, Pontoporiidae e Iniidae | CAPES | Profª. Mariana Freitas Nery | 10/2023 | 03/2024 | 48 cores / 128GB RAM |
Tabela 05: projetos em andamento.
6) Projetos finalizados
Projetos Científicos finalizados |
Nome do Projeto | Processo(s) | Prof. Responsável /alunos PG | Data de início | Data de conclusão | Recursos alocados (CPU/Mem) |
eDNA: diversidade e conservação de anfíbios dos Campos de Floresta com Araucárias | Fapesp: 16/25358-3 Fapesp: 20/02994-7 | Prof. Luís Felipe de Toledo Ramos Pereira / Júlia Renata Ernetti | 07/2021 | 09/2021 | 16 cores / 16GB RAM |
Padrões para diversidade beta taxonômica e filogenética e os processos estruturantes das comunidades de espécies arbóreas nas florestas da Amazônia | Fapesp: 20/03379-4 | Profª Clarisse Palma da Silva / Dr. Bruno Garcia Luize | 08/2021 | 11/2021 | 16 cores / 400GB RAM |
Planejamento e síntese de novos fosfolipídios antitumorais inibidores da enzima trifosfato de citidina (CTP):fosfocolina citidililtransferase humana. | Fapesp: 18/08585-1 | Prof. Daniel Fábio Kawano (FCF) | 08/2022 | 09/2022 | 12 cores / 32 GB RAM |
Tabela 06: projetos finalizados.
