A pós-graduação do Instituto de Biologia abrange todas as grandes áreas das Ciências Biológicas com  objetivo de produção científica, tecnológica e cultural e formação de pesquisadores e profissionais de alto nível.
 
Os sete programas de pós-graduação, Biologia Celular e Estrutural, Biologia Funcional e Molecular, Biologia Vegetal, Ecologia, Genética e Biologia Molecular, Biociência e Tecnologia de Produtos Bioativos e Biologia Animal, têm identidade acadêmica bem definida sem, no entanto, perder seu caráter multidisciplinar e.  oferecem cursos de mestrado e doutorado.